あのプリンセス エヴァンジールが携帯コミックとなって登場！借金を背負わされた小此木 正也は、瓏仙院 理瀬と運命的な出会いを果たし、ヴァンセンヌ女学園へと編入した。しかし、学園では「男女共学化」を巡って改革派と守旧派が激しく対立している。正也は男子のサンプルとして、お試しで受け入れられたのだが…。ほとんどの人間が改革を望んでおらず、正也と理瀬は二人きりの戦いを強いられる。また、一学期の最後に選挙があり、それに負ければ正也は放校処分となってしまうのだ。逆境の中、ドタバタの騒動を起こしながら、美少女たちと交流を深めていく正也。果たして彼は、ヴァンセンヌの乙女たちに受け入れられるのか！？