オメガ・シンドローム――健康診断の結果、耳慣れない病名を告げられた西宮ハル（にしみや）。
高校の同級生であり主治医の葛木（かつらぎ）との再会に驚いたのも束の間、男なのに妊娠できる可能性があると告げられて――！？同性を誘惑するフェロモンに発情期！？理解不能な症状に混乱するハルをよそに体の変化は始まっていて…。
オメガバースの世界観を元に、オメガが発見されたばかりの世界を描く、過去の因縁と運命に翻弄される二人の物語。
「俺がお前を抱くなんてことは死んでも有り得ない。
」「俺は昔からお前のことが大嫌いだからな」葛木が一方的にハルを嫌い続ける理由とは――？