ブロッコリー×カズキヨネによるゲームのコミカライズ最終巻第3巻。
ゲーム・アニメとは異なる感動の結末を新鋭・墨田モトが描く！ 世界は「人間嫌いの問題児」である神々の存在で、憂慮すべき事態を迎えようとしていた。
この事態を打破すべく神の代表・ゼウスによって天上の『学び舎』へと召喚された少女・結衣。
神々に‘愛と人間’を理解させ学園から卒業させることが結衣に与えられた使命だった。
学園生活を通して徐々に心を通わせ始める結衣と神々。
卒業資格を得る者も多い中、優等生と思われたアポロンの抱える「問題」はいまだ解決していなかった。
果たして結衣はアポロンの心を救い、世界と人類の終焉を食い止めることができるのか…？