佐土原藩島津忠広（二万七千石）次席家老・宗方義家の屋敷にて重大な話し合いが行われていた。
その内容とは屋敷に出入りしていた商人に小判を預けたところ、道中に強奪され斬殺され、その後に送った密偵達も次々と殺されてしまったという重大な話だった。
今後どうしたら良いものか困り果てていると、一人の男が「闇飛脚」なる高額の報酬が必要ではあるが凄腕の三次という男がいるという。
さっそく三次に仕事を頼み重要な物を渡すと、その情報はすでに商人を斬殺した敵の親玉に伝わっており…。
果して闇飛脚・三次はこの危機をどう乗り越えるのか！闇から闇へと移動し飛脚仕事をこなす「闇飛脚・三次」を描く！！