2035年、近未来の日本。
「人口生体」の研究中に起きた大事故’バースト’により、暴走した人口生命体’マター’が黒部峡谷一帯を侵食。
人類にとって希望の地と謳われた研究都市は、政府によって立ち入りが禁じられた。
それから2年後ーー。
バーストで家族を失った15歳の橘アイコは、転校生の神崎雄哉から信じがたい事実を告げられる。
それはアイコも知らなかった、自身の身体に隠された’秘密’だった。
それを解く鍵は、バーストの中心地’プライマリーポイント’にあるという。
アイコは、案内人の神崎雄哉と護衛部隊のダイバーたちと共に、封鎖されたエリアの侵入を決意するが……。
人類の未来を背負う少年、少女が出会った時、明らかになる真実とは？