高校生・天宮晴輝の住む町は、ある日突然、人を襲う’保菌者’によって埋め尽くされてしまった…。
蠢く大量の’保菌者’から逃げ切れるのか！？ 絶望的サバイバル、開幕！ 変わり果てた人間が町を襲い、変わり果てた町が人を阻む！！ いつもの道を、命を懸けて駆け抜けろ！秋保を脱出し日常を取り戻す！ そのために動き出した晴輝達。
だが計画の前日…天宮螢は国会爆破の容疑をかけられ、銃弾を浴びてしまう。
迎えた脱出当日、晴輝は不穏分子処刑のため高木譲のもとへ向かう。
しかし、その真の目的は友人である高木の命を救うことだった。
それに対し高木は警告する…秋保は犯人が作り出した’実験場’であると。