新たな悪の組織「エデアル」に占拠された新島! 島民を救い出すべく孤独な戦いを始めた宮士郎と五輪真由美の前に、宮と同じ機械の身体を持つ謎の男が現れる!! 一方、「ヘルトピア」の生き残り・平甲児は、エデアルの秘密を探るため、日本軍の隠された遺産が眠るという島の地下へと潜入を試みるが…!?