独立宣言して早くも一年、フローラたちの王国も遂に初めて隣国と国交を結ぶことに。
幼い頃に知り会った皇子が海路で来るはずが、ワイバーンに襲われ、あわや難破！？リベルとあっさり救出したフローラが領地ドラッセンに案内すると、広大な農場に温泉街にと驚かれ通しで……。
皇子は兄のライアスと仲良くなったり、ネコ精霊をモフったり楽しそうだけど、なんだかフローラに思う所があるようで……？ 今回はカメ精霊にカモメ精霊、勿論ネコ精霊が大活躍！！※本作品の電子版には本編終了後にカドカワBOOKS『サイレント・ウィッチ 沈黙の魔女の隠しごと』（著:依空 まつり）のお試し版が収録されています。