《継ぎ接ぎ公爵》レオ・フランケンシュタインを退けた怜生。
それを期に連盟は、妖精人の国を建立する計画を本格始動させる。
一方〈青の医術師団〉が世界的な糾弾の対象となり、その騒動を衝いて人造人間（ホムンクルス）の少女たちが脱走を果たす。
彼女たち、イロハ、ニイナ、サクヤは自分たちの夢を叶えるため〈緋の龍王〉に戦いを挑むのだが――。
さらに、既にこの世に存在しないはずの人物までもが、怜生の前に姿を現す。
誰もが夢を憧れを願いを抱き相対する黄金巨樹の上、怜生と花蓮は理想郷に至るのか！？ 超絶過激な魔王の狂宴、再び誓いの言葉を交わす第三幕！