「嘘だよっ、そんなことっ」砂沙美の悲痛な叫びがこだまする。
「美紗緒ちゃんが…ピクシィミサだなんてっ！」倒壊した家々。
重傷を負った天地―雷凰区決戦でミサが砂沙美に残した傷跡は深い。
本当にあんなひどいことを美紗緒がやったんだろうか？揺れる心を抱えて、砂沙美は街へ飛び出した。
その頃、太平洋沖に異常事態が発生していた。
突如、空に現れた巨大な魔法戦艦！魔法使い華津麻の助力を得た裸魅亜が、全魔法力を注ぎ込んで最後の決戦を仕掛けてきたのだ！！地球を脅かす脅威となった裸魅亜を、傷心のサミーは止められるのか？そして砂沙美と美紗緒―ふたりの友情は！？『魔法少女プリティサミー』シリーズ、感動の最終巻。