西暦2003年の世界から、太平洋戦争敗戦直前の1945年にタイムスリップした日本国防軍の原子力空母『大和』は近代兵器の威力をもって、沖縄を米軍から解放。
さらに、原爆の本土投下を阻止し、戦いの形勢を逆転させたのだった。
かたくなに休戦交渉を拒むトルーマン米大統領に対し、『大和』は第2次真珠湾攻撃、米本土爆撃と、獅子奮迅の戦いを繰り広げ太平洋から米艦隊を一掃した。
危機に立たされたトルーマン大統領が、ソ連と密約を結んだことにより戦線はさらに拡大し、米ソ2大国を相手に『大和』は日本陸海軍と共に最後の戦いをいどむのだった。
草薙圭一郎が抜群のアイディアで描く、超人気シミュレーション・シリーズ、遂に完結。