正体不明の大衝撃により、太平洋戦争のまっただ中にタイムスリップしてしまった海上自衛隊の最新鋭潜水ヘリ空母「やまと」は、敗色濃い日本軍を支援し、ハワイを占領した。
なんとか日米講和に持ちこもうとする日本政府だが、ルーズベルト大統領は憎悪に燃え、戦争を継続しようとした。
スイスからホワイトハウスに拉致されてしまった日米講和の特使の郷原たちを救出した潜水空母「やまと」の戦闘員は、こんどは逆にルーズベルト大統領を「やまと」に拉致して日米講和を説得した。
あくまでも日本の三国同盟脱退を許さないヒトラーは、ルーズベルトもろとも「やまと」を葬り去ろうと、海の群狼・Uボートを太平洋に放った。
東条首相は日米講和のためにハワイの即時返還を決意し、山本五十六長官を全権特使としてチャーチルらの待つケベック会議に送りこんだが、果たして日米講和はなるのか！？超人気シリーズ『時空戦艦「大和」』の草薙圭一郎が再び挑むタイムスリップ・シミュレーション戦記の傑作、遂に完結。