前回、小さな勝利を収めた司令と美少女戦車隊だったが、勝利の余韻に浸る間もなく次々と凶悪怪獣が出現し、壊滅寸前に追い込まれてしまう！ 新しいメンバーと新戦車追加で戦力の立て直しを図るも、またまた別の凶悪怪獣が出現！ 隊員たちの疲弊も激しく、愛する戦車をボロボロにされ、このままでは士気にかかわると司令官が出した命令はなんと「バケーション・デイ」！ 突然の休暇に喜ぶ隊員たち。
一方、司令官は新たに召喚されたマニアックな戦車の改造に頭を悩ませていた──。
ライバル（？）の偽パイパー隊も巻き込んで、怪獣軍団攻略へ挑む美少女戦車隊！ 鉄壁の防御を誇る怪獣を倒すカギはまさかのアレだった！？