中部太平洋で大激戦が繰り広げられるなか、富嶽編隊がルーズベルトの野望を打ち砕く！昭和18年2月、日本軍はガダルカナル島からの撤退を始めた。
この撤退を機に、最前線からは富嶽よりも目の前の実践で役に立つ航空機を要求する声が大きくなっていく。
富嶽が無用の長物でないことを証明する必要に迫られた一〇二二空は、富嶽試作機で真珠湾の爆撃を決行する。
甚大な被害をもたらしたものの、米軍は中部太平洋から日本軍基地を攻め入るガルパニック作戦の実施を決断。
そして、日本軍はシアトルにあるB29の開発拠点の情報を手に入れる。
富嶽編隊は、その開発拠点の破壊のため、シアトルへと飛び立つのだった……。
中部太平洋に迫る米軍の脅威、「マンハッタン計画」は果たして実行されるのか？